69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1784 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  100 
 
 		 393 aa  814    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0640  filamentation induced by cAMP protein Fic  79.89 
 
 		 501 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0716  filamentation induced by cAMP protein Fic  76.14 
 
 		 498 aa  591  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.36 
 
 		 499 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.74 
 
 		 495 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2183  fic family protein  40.16 
 
 		 491 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723486  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4097  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.81 
 
 		 544 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  25.68 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  25.81 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.41 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.79 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.69 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.14 
 
 		 252 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.12 
 
 		 508 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.98 
 
 		 247 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.18 
 
 		 531 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  54.3  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.81 
 
 		 533 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.71 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.74 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.2 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.71 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  24.77 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.25 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  28.28 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 541 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 248 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.89 
 
 		 243 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  37.04 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.64 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.23 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  25.27 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.94 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.83 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  26.63 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  34.85 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.61 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.58 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  27.33 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.33 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.73 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1572  hypothetical protein  43.48 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.322464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.28 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  26 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  24.6 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.36 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.9 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  30.38 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  24.62 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.91 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.79 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.27 
 
 		 245 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.45 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.45 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.61 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.92 
 
 		 248 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  24.71 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.97 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.89 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>