68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1123 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 499 aa  1036    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.51 
 
 		 495 aa  342  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2183  fic family protein  39.52 
 
 		 491 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0640  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.92 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0716  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.95 
 
 		 498 aa  326  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  44.05 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4097  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.59 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.79 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.15 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.64 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.66 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.15 
 
 		 247 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.66 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.91 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.34 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.94 
 
 		 247 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  28.8 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  29.21 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.37 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.68 
 
 		 529 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.02 
 
 		 250 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.87 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.52 
 
 		 245 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.53 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0913  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.98 
 
 		 245 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.876617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.88 
 
 		 358 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.92 
 
 		 508 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  27.73 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.38 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.14 
 
 		 531 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.48 
 
 		 250 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 377 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  30.67 
 
 		 271 aa  50.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  26.41 
 
 		 328 aa  50.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.89 
 
 		 248 aa  50.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.59 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  24.89 
 
 		 249 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.29 
 
 		 380 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 256 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 386 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  28.75 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  38.89 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  24.39 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3558  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.08 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  25.52 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  40.35 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  40.35 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3460  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.79 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 226 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  35.63 
 
 		 613 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  25.73 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.71 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.11 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3106  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.35 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  26.72 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.88 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.39 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3262  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.74 
 
 		 466 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.793632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  26.77 
 
 		 372 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  25.27 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.85 
 
 		 360 aa  43.5  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>