144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2616 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  92.34 
 
 		 261 aa  497  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  34.78 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3460  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.96 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.53 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.96 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.84 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  31.82 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.85 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.54 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.68 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.75 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.57 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.17 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.86 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  30.81 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.4 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  32.27 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.85 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  30.09 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.67 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.13 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.31 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  32.11 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.32 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0774  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.86 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000913684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  25.62 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  29.69 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  28.65 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.88 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.77 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.48 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3516  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.73 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.438285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.38 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4356  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.33 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.871364  normal  0.139855 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  44.78 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.88 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  28.93 
 
 		 502 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  26.54 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  26.54 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.92 
 
 		 502 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  26.24 
 
 		 388 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 333 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.39 
 
 		 508 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 387 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.88 
 
 		 336 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.76 
 
 		 531 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  23.95 
 
 		 352 aa  52  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.27 
 
 		 500 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.24 
 
 		 386 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4940  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.12 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857933  normal  0.500548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.17 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.23 
 
 		 541 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.51 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 		 392 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.33 
 
 		 508 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1107  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.04 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.06 
 
 		 345 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  25.43 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.23 
 
 		 508 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.08 
 
 		 509 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  26.99 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1178  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.5 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0838  Fic family protein  26.02 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0586885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  23.96 
 
 		 330 aa  48.9  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1051  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.5 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.01 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1819  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.44 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 394 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  24.74 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.11 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.59 
 
 		 653 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.35 
 
 		 488 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.8 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 495 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 393 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 533 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 386 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  25.71 
 
 		 386 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.66 
 
 		 384 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.24 
 
 		 390 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0055  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.37 
 
 		 434 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0125874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.62 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.33 
 
 		 443 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  24.81 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  32.18 
 
 		 377 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2183  fic family protein  21.97 
 
 		 491 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.4 
 
 		 368 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  20.76 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.41 
 
 		 384 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  31.76 
 
 		 406 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  32.65 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.62 
 
 		 407 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  35.82 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 394 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>