81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3975 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 495 aa  989    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2183  fic family protein  43.33 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723486  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.51 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0640  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.64 
 
 		 501 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0716  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.11 
 
 		 498 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4097  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.25 
 
 		 544 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  41.74 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  27.6 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.81 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.85 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.39 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.24 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.25 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.43 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  25.75 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.16 
 
 		 529 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.05 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 248 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.04 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0838  Fic family protein  29.63 
 
 		 236 aa  54.3  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0586885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 256 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.47 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.44 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.68 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  29.41 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.14 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  25.69 
 
 		 271 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1819  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.65 
 
 		 250 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.76 
 
 		 299 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  25.1 
 
 		 321 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.83 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.5 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  25.12 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.35 
 
 		 250 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  24.44 
 
 		 253 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.87 
 
 		 251 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  29.02 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 508 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  24.89 
 
 		 253 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.06 
 
 		 533 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.98 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.1 
 
 		 541 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.04 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0913  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.5 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.876617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3558  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.22 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  26.29 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.8 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.98 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  30.85 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.8 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.67 
 
 		 253 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  26.26 
 
 		 240 aa  47.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  50 
 
 		 261 aa  47.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  28.07 
 
 		 261 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  41.27 
 
 		 153 aa  47.4  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.65 
 
 		 377 aa  46.6  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.71 
 
 		 349 aa  47  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4940  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.67 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857933  normal  0.500548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  31.4 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.26 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 226 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.84 
 
 		 393 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.63 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.54 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.67 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  24.39 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  29.61 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.92 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.19 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  34.78 
 
 		 346 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.38 
 
 		 358 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.7 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3262  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.49 
 
 		 466 aa  43.5  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.793632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>