203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1106 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  80.81 
 
 		 541 aa  894    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 533 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.19 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  46.61 
 
 		 502 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.12 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.15 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.94 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.93 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.33 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.42 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.19 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.42 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2034  hypothetical protein  27.7 
 
 		 335 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  86.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.18 
 
 		 267 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.18 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.61 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.75 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.43 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.93 
 
 		 251 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 248 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.66 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  38.32 
 
 		 271 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.62 
 
 		 248 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  29.36 
 
 		 240 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.2 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.96 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.93 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.63 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  38.14 
 
 		 252 aa  63.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  31.67 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  31.68 
 
 		 330 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  34.38 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  31.37 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  39.73 
 
 		 253 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.96 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.68 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.68 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.21 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.66 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  39.73 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  39.53 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  30.84 
 
 		 331 aa  57  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 388 aa  57  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.71 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  30.3 
 
 		 328 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.46 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  29 
 
 		 331 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.12 
 
 		 334 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.07 
 
 		 358 aa  53.5  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  38.81 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.34 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.51 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.67 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0716  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.81 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.06 
 
 		 345 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 306 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.25 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4097  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.95 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.66 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.38 
 
 		 373 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 356 aa  51.2  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.17 
 
 		 371 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.68 
 
 		 375 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.89 
 
 		 377 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  34 
 
 		 391 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0640  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.92 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.71 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.35 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.91 
 
 		 376 aa  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  30.48 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.48 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  33.65 
 
 		 195 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.09 
 
 		 304 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.92 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  31.36 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  38.1 
 
 		 342 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.06 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.66 
 
 		 387 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.38 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  30.48 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.11 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  27.07 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.51 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  26.29 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>