61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4245 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  58.16 
 
 		 200 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  43.88 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  42.86 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2242  mobile mystery protein B  42.11 
 
 		 198 aa  161  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.87022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  40.72 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0743  mobile mystery protein B  40.53 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.302494  normal  0.0731737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  41.45 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  39.79 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  38.14 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  41.1 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5362  mobile mystery protein B  36.98 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.088226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  44.78 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  44.78 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.26 
 
 		 500 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.11 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  27.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.33 
 
 		 502 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  28.93 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.16 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.91 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.1 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.11 
 
 		 488 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.5 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  30 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.33 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.16 
 
 		 333 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.06 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  26 
 
 		 326 aa  45.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 411 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.06 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.97 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.66 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  31 
 
 		 498 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  24 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.28 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0444  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.63 
 
 		 365 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.401408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  24.27 
 
 		 388 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.78 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 400 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  24.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  38.46 
 
 		 400 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.16 
 
 		 417 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.49 
 
 		 384 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.51 
 
 		 386 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  23.87 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  31.2 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.89 
 
 		 317 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  25.15 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 393 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  25.25 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0838  Fic family protein  22.42 
 
 		 236 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0586885  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 362 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>