265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3926 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 500 aa  1032    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.04 
 
 		 488 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.75 
 
 		 502 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.05 
 
 		 256 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  27.38 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.69 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.3 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.55 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.91 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  30.08 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  32 
 
 		 271 aa  67  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  24.76 
 
 		 328 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.14 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  34.86 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.52 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  28.88 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.64 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  27.75 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.97 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  30.93 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  32.33 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0838  Fic family protein  26.92 
 
 		 236 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0586885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.53 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1819  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.58 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.28 
 
 		 299 aa  62  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  35 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.77 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  32.06 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.6 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.07 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.88 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.96 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.11 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  30.88 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.69 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.59 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.89 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.41 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.54 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.58 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.76 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  28.39 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.86 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.86 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.02 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  39.22 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  32.63 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.13 
 
 		 370 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.48 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.35 
 
 		 226 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.85 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  28.05 
 
 		 503 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 384 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 250 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  22.17 
 
 		 261 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.83 
 
 		 368 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 247 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  26.47 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.25 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.38 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  27.78 
 
 		 194 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.42 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.52 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  22.95 
 
 		 271 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.4 
 
 		 502 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.74 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  40 
 
 		 194 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.01 
 
 		 345 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.51 
 
 		 385 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  29.17 
 
 		 369 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.74 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 349 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  40.26 
 
 		 203 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.72 
 
 		 380 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  28.74 
 
 		 358 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  39.71 
 
 		 359 aa  53.5  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.76 
 
 		 398 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.12 
 
 		 392 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  26.9 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.67 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.73 
 
 		 360 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  38.75 
 
 		 194 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.12 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.48 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.57 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.34 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  24.68 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>