80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1391 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  74.09 
 
 		 194 aa  304  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  69.43 
 
 		 194 aa  281  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  57.89 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0743  mobile mystery protein B  51.79 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.302494  normal  0.0731737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2242  mobile mystery protein B  49.74 
 
 		 198 aa  210  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.87022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  54.12 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  52.94 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  54.61 
 
 		 153 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  40.72 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  38.27 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5362  mobile mystery protein B  46.81 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.088226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.52 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.9 
 
 		 502 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.24 
 
 		 488 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.46 
 
 		 250 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.86 
 
 		 386 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 351 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.46 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.54 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 317 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.61 
 
 		 251 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.95 
 
 		 347 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  29.03 
 
 		 352 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  31.67 
 
 		 252 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  24.35 
 
 		 328 aa  48.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.66 
 
 		 371 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  27.34 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.34 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.08 
 
 		 384 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1516  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.183855  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  35 
 
 		 412 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.49 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.5 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.5 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.83 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.18 
 
 		 248 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  28.15 
 
 		 388 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  24.3 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.85 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.31 
 
 		 252 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 358 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.31 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 349 aa  45.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.66 
 
 		 370 aa  44.7  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.43 
 
 		 349 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.5 
 
 		 408 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.91 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1819  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.79 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.1 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  29.27 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  28.93 
 
 		 374 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.71 
 
 		 294 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.12 
 
 		 388 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.54 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.25 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.36 
 
 		 378 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  40.38 
 
 		 331 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.54 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  26.95 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  28.85 
 
 		 271 aa  42.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.82 
 
 		 328 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 373 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.36 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 377 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  25.86 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  34.38 
 
 		 346 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.03 
 
 		 398 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 194 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  27.61 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  36.07 
 
 		 360 aa  41.6  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.13 
 
 		 380 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.13 
 
 		 380 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.09 
 
 		 247 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>