67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0546 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  100 
 
 		 200 aa  420  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.92 
 
 		 194 aa  241  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.85 
 
 		 194 aa  232  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.33 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.23 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.88 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  43.88 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  43.88 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  41.92 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  41.41 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  41.41 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  41.41 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  41.41 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  43.43 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.33 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  39.3 
 
 		 197 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.68 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  33.68 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.18 
 
 		 362 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.07 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  36.46 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.37 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.94 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  29.41 
 
 		 354 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.58 
 
 		 349 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.82 
 
 		 175 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  31.79 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.35 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  35.21 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.06 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  31.74 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  33.57 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 287 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  33.81 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.68 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  30 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  28.39 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.59 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.28 
 
 		 432 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  30.66 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.17 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.26 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.46 
 
 		 430 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  26.77 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5375  hypothetical protein  40.79 
 
 		 105 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.392977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  28.57 
 
 		 346 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0444  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.7 
 
 		 365 aa  48.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.401408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  28.71 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.2 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  27.12 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  24.3 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  30.77 
 
 		 388 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  26.77 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  28 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  24.32 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  25.25 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.15 
 
 		 248 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>