59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0216 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.31 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.05 
 
 		 203 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  36.05 
 
 		 203 aa  90.1  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  31.4 
 
 		 197 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.34 
 
 		 202 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.7 
 
 		 201 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  30.11 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  30.11 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.11 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  31.25 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  28.35 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  31.25 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  31.25 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  31.25 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  31.25 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  27.78 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  29.55 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  29.55 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  29.55 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  29.55 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  29.55 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.08 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  32.29 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  29.33 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.98 
 
 		 194 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  30.11 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.8 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  31.36 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.89 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  30.77 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.52 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.78 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.18 
 
 		 189 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  29.24 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.19 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.86 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.93 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.95 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  32.18 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.05 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  28 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.12 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.54 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.33 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0744  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.89 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  27.64 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  26.71 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  23.9 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.74 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.61 
 
 		 181 aa  45.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  27.94 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  26.11 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  24.43 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  28.85 
 
 		 194 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>