30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2242 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2242  mobile mystery protein B  100 
 
 		 198 aa  411  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.87022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0743  mobile mystery protein B  78.28 
 
 		 198 aa  342  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.302494  normal  0.0731737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  49.74 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  48.98 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  47.45 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  46.56 
 
 		 195 aa  187  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  46.73 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  42.33 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  42.11 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  41.21 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  46.94 
 
 		 153 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5362  mobile mystery protein B  42.02 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.088226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.74 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.66 
 
 		 256 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.04 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.69 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.81 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  25 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  26.59 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.35 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.49 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11071  hypothetical protein  36.25 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.103512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.17 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  24.34 
 
 		 346 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 386 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  24.03 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.28 
 
 		 364 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  28.28 
 
 		 388 aa  41.2  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>