74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0004 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1391  Fic family protein  54.12 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  53.85 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  53.89 
 
 		 194 aa  201  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  51.78 
 
 		 195 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2242  mobile mystery protein B  46.73 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.87022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0743  mobile mystery protein B  47.24 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.302494  normal  0.0731737 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  48.69 
 
 		 198 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  48.94 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1581  mobile mystery protein B  38.78 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  38.14 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5362  mobile mystery protein B  45.5 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.088226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.55 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.81 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  29.55 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 502 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.43 
 
 		 248 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.99 
 
 		 317 aa  51.2  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.97 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.46 
 
 		 326 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.37 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.02 
 
 		 500 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.75 
 
 		 380 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.83 
 
 		 380 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.58 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 252 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.78 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.15 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.11 
 
 		 267 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 386 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.71 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  29.84 
 
 		 261 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.84 
 
 		 498 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.26 
 
 		 488 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  27.12 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.7 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  32.48 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1516  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.183855  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.58 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  27.63 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.63 
 
 		 394 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.9 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  25 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  26.92 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.08 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.48 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.47 
 
 		 417 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  46.27 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  27.03 
 
 		 348 aa  45.1  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 508 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  23.08 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.81 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.24 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  28.78 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.21 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.28 
 
 		 531 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.31 
 
 		 396 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.5 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 328 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 380 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.39 
 
 		 345 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.57 
 
 		 351 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.26 
 
 		 194 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.48 
 
 		 397 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  25.58 
 
 		 380 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  25.58 
 
 		 380 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.58 
 
 		 380 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.12 
 
 		 404 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  41.43 
 
 		 390 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 400 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>