57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3265 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  91.75 
 
 		 194 aa  373  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  90.21 
 
 		 194 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  52.33 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.81 
 
 		 201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  37.82 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  37.82 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  37.82 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  37.82 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  37.31 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  38.34 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  36.27 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  41.21 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  35.75 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  35.75 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.08 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  35.08 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.5 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.98 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.41 
 
 		 362 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.62 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.54 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 225 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  31.89 
 
 		 239 aa  87.8  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.88 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  26.51 
 
 		 354 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  31.05 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.34 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.8 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.25 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  29.21 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  31.85 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  30.77 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  24.43 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  33.09 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  29.73 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.65 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  33.05 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.23 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  28.26 
 
 		 346 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.57 
 
 		 293 aa  51.2  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5375  hypothetical protein  32.14 
 
 		 105 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.392977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  31.73 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  26.26 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.64 
 
 		 430 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>