55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2140 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  82.09 
 
 		 201 aa  348  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  60.2 
 
 		 202 aa  261  6e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.47 
 
 		 181 aa  211  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.62 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  52.54 
 
 		 189 aa  202  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3061  Fic family protein  57.3 
 
 		 96 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163201  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  33.52 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  32.08 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.9 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.36 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  31.33 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.81 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.59 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  32.59 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.48 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  28.11 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  25.79 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  25.79 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  25.79 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  25.79 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  25.79 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  27.01 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  26.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  27.01 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  27.65 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  26.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  26.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  26.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  27.01 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  27.01 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  32.45 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.16 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.4 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.65 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.12 
 
 		 294 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  29.07 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  26.47 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.23 
 
 		 330 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  25.36 
 
 		 354 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.78 
 
 		 430 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0744  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.21 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.68 
 
 		 349 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.73 
 
 		 287 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>