127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0608 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  97.84 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.48 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  38.14 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0310  filamentation induced by cAMP protein Fic  98.18 
 
 		 55 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0312  hypothetical protein  96.43 
 
 		 67 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  30.77 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.6 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.34 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.67 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  31.93 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.73 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.04 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  31.76 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.19 
 
 		 362 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.72 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  29.45 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.87 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  31.87 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  26.8 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  29.17 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.65 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  25.26 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  25.26 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.07 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.59 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  25.26 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.13 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.49 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.8 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0003  cell filamentation protein  25.83 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.587575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  37 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  29.8 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  26.04 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  25.25 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  25.25 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  25.25 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  26.6 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2242  mobile mystery protein B  26.74 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.87022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.72 
 
 		 502 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  28.19 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  24.75 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.87 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  30.94 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.74 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.72 
 
 		 267 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  24.73 
 
 		 346 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  26.09 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  34.67 
 
 		 271 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.15 
 
 		 377 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.42 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.72 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  32.18 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  41.33 
 
 		 359 aa  47.8  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.89 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.15 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  28 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  30.63 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 400 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.71 
 
 		 412 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.49 
 
 		 349 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.82 
 
 		 349 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.13 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4245  mobile mystery protein B  26.06 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0743  mobile mystery protein B  24.71 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.302494  normal  0.0731737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.08 
 
 		 373 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  29.73 
 
 		 271 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.11 
 
 		 358 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  36.11 
 
 		 400 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  36.23 
 
 		 395 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  36.11 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  29.06 
 
 		 377 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.68 
 
 		 396 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.38 
 
 		 500 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.92 
 
 		 368 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 377 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.64 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.56 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.12 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  25.66 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  25.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0444  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.401408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>