85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4358 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  100 
 
 		 346 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.6 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  30.23 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.08 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.57 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  31.78 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.79 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.54 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.61 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  29.06 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.78 
 
 		 189 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  27.15 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.68 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.64 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  28.93 
 
 		 197 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 194 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  28.67 
 
 		 220 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.25 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.45 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.26 
 
 		 194 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0744  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6305  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.62 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  30.97 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  28.57 
 
 		 200 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.62 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.73 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.18 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2940  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.25 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.0280417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.52 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.76 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  24.67 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0774  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.69 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000913684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  25.69 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  23.57 
 
 		 200 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.67 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  25.69 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.57 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  23.57 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  23.57 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  23.57 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  23.57 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  23.57 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  30.51 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.71 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  27.78 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  28.7 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.93 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.72 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.38 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  28.69 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0004  mobile mystery protein B  27.1 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  32.56 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  28.07 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.31 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.69 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  46.51 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  27.14 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.76 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.31 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.8 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2788  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.81 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0722811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  57.58 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.68 
 
 		 401 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.68 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.69 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  23.03 
 
 		 198 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  25.69 
 
 		 200 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.15 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.51 
 
 		 406 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>