286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2613 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  67.74 
 
 		 248 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.85 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.43 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.26 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.1 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.28 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.5 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.62 
 
 		 317 aa  178  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  42.61 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.66 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  39.11 
 
 		 328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.25 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.45 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  38.5 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.77 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.04 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.4 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.21 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  36.76 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  34.96 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  36.59 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.46 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 335 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  33 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.94 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  30 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.34 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.34 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  29.57 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  29.57 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  29.85 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  26.75 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  30.28 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  32.69 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.84 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  30.29 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  33.49 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  30.73 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 529 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.36 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.33 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.88 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.28 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.21 
 
 		 509 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  35.25 
 
 		 502 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  25.42 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0913  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.876617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.96 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.84 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  28.43 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0774  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000913684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.62 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.6 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4356  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.871364  normal  0.139855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 541 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.05 
 
 		 508 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  31.63 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.32 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  29.9 
 
 		 352 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.04 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.96 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.94 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  27.94 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  27.94 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1640  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.38 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1107  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.78 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1178  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.78 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  34.87 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1051  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.78 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1819  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.76 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.25 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  25.39 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.63 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  25.21 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  31.71 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.44 
 
 		 531 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2657  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.32 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  32.35 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  29.21 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  28.4 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  29.21 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.19 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.35 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.64 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.1 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.21 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.65 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3106  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.18 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.2 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>