113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4020 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  88.72 
 
 		 400 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 400 aa  816    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  67.26 
 
 		 413 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.81 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  52.03 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.16 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  44.16 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.84 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.52 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.9 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1372  fic family protein  42.41 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.82 
 
 		 404 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.79 
 
 		 417 aa  229  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3358  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.52 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  37 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.59 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.92 
 
 		 407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.41 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.74 
 
 		 397 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.75 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.87 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.17 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.25 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  43.64 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  31.88 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.25 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0317  hypothetical protein  48.18 
 
 		 172 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0608446  normal  0.0902028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.85 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.49 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.81 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  32.69 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  32.69 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.69 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.1 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  22.13 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.04 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.78 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  24.42 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.35 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  26.15 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.37 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.46 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.45 
 
 		 256 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.94 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.88 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.07 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.88 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  24.42 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  23.46 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.5 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.06 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1455  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.12 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184885  normal  0.0996953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  24.76 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.71 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  23.43 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.29 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.66 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  41.1 
 
 		 220 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  37.93 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.85 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 204 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.33 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 267 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.87 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.78 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 364 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  36.11 
 
 		 185 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  36.84 
 
 		 330 aa  46.6  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  28.33 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.75 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  27.38 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  27.47 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  28.96 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.24 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.58 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  29.85 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.19 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  29.95 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.59 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  32.5 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.25 
 
 		 496 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.41 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.6 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0055  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.12 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0125874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.73 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.58 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  25.89 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.71 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.87 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.55 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>