63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2380 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  52.56 
 
 		 342 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  53.33 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  48.28 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  55.93 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.94 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  53.7 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.59 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  47.3 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 480 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.56 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  37.65 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  32.9 
 
 		 475 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 478 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 477 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 480 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0363  divergent AAA ATPase  41.56 
 
 		 95 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 413 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 412 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  55.26 
 
 		 454 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 412 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  48.98 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  42.31 
 
 		 330 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 402 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 467 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  36.84 
 
 		 479 aa  48.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  36.84 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 484 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  37.5 
 
 		 483 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  36.71 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 620 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 620 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 519 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  34 
 
 		 314 aa  45.1  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.84 
 
 		 548 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 502 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  40 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 471 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 545 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 		 494 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  44.44 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 385 aa  43.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  63.33 
 
 		 561 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2244  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 82 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 462 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 492 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 458 aa  41.2  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>