37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0527 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  882    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.01 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.06 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 209 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 230 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 223 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 494 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 208 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.58 
 
 		 463 aa  46.6  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  28.93 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  20.45 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  31.13 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 485 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 481 aa  43.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>