73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1587 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  58.3 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  54.67 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  55.16 
 
 		 223 aa  244  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  58.74 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  30.59 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 620 aa  62  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  26.62 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.17 
 
 		 382 aa  55.1  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 455 aa  55.1  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 433 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  27.74 
 
 		 429 aa  53.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 545 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 485 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 385 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 469 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 484 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 477 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 467 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 471 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  22.92 
 
 		 396 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  38.36 
 
 		 403 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 403 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  27.27 
 
 		 462 aa  48.9  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 1672 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 1687 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 478 aa  48.5  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 430 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 386 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 446 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  29.7 
 
 		 548 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  32.93 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 448 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 489 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 360 aa  45.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  22.31 
 
 		 356 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 481 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  36.76 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 458 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 632 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3426  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 438 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 492 aa  42.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 499 aa  42.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 		 377 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 422 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 433 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 485 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 		 377 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  28.1 
 
 		 777 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  30.84 
 
 		 543 aa  41.6  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 561 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>