90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1271 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  43.78 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  36.76 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  33.95 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 412 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 		 160 aa  89  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 413 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 412 aa  85.5  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.5 
 
 		 480 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 402 aa  72  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 471 aa  68.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 412 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  31.11 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  29.47 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  29.91 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 374 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  40.18 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  49.28 
 
 		 448 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 463 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 396 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 455 aa  53.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  31.4 
 
 		 770 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 455 aa  52  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  34.48 
 
 		 555 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 561 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 448 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 467 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 390 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 389 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  28.23 
 
 		 479 aa  49.7  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  47.06 
 
 		 548 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 		 377 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 		 360 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 556 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 		 377 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 313 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 485 aa  48.5  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 498 aa  48.5  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 423 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 422 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  31.15 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 		 499 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 545 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 611 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 467 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  28.19 
 
 		 382 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  38.38 
 
 		 423 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.26 
 
 		 462 aa  46.2  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 475 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 492 aa  45.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  38.18 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 462 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 456 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 456 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 423 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  20.45 
 
 		 429 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.13 
 
 		 481 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  32.92 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  26.97 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 586 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 458 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  30.09 
 
 		 348 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6893  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 230 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  37.04 
 
 		 277 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 545 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 446 aa  42  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>