32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1151 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  329  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  85.38 
 
 		 499 aa  295  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1442  putative transcriptional regulator  75.46 
 
 		 179 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1148  hypothetical protein  90.38 
 
 		 113 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 485 aa  94  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  39.74 
 
 		 314 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  38.46 
 
 		 322 aa  89.4  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  38.27 
 
 		 483 aa  87  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 522 aa  80.5  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  34.29 
 
 		 526 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 620 aa  70.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  53.7 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 480 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 519 aa  57.4  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 508 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 509 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 480 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 494 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 235 aa  51.6  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  39.68 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.91 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.8 
 
 		 336 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 498 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 502 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 481 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 471 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  42.37 
 
 		 224 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.23 
 
 		 334 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 620 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 620 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 477 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>