46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0157 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  100 
 
 		 382 aa  780    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  34.86 
 
 		 217 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  36.49 
 
 		 705 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 313 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  29.11 
 
 		 221 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  34.15 
 
 		 778 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  37.27 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  32.47 
 
 		 756 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  31.08 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  38.68 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 632 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  28.48 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  26.71 
 
 		 764 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  26.59 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  26.06 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  30.58 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  32.35 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  31.9 
 
 		 207 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 469 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 499 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 		 241 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 209 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  22.06 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  25.25 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  35.71 
 
 		 483 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  29.17 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 218 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 485 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 223 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2047  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 448 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.47 
 
 		 555 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 485 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>