85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0336 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  68.45 
 
 		 548 aa  777    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1446    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  47.77 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  29.71 
 
 		 522 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  24.16 
 
 		 778 aa  203  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  24.49 
 
 		 764 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  28.03 
 
 		 756 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  25.08 
 
 		 690 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  23.86 
 
 		 592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  23.22 
 
 		 615 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  24.28 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  23.17 
 
 		 593 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  23.59 
 
 		 575 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 492 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.75 
 
 		 575 aa  120  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 632 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  23.28 
 
 		 570 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  23.22 
 
 		 598 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  24.11 
 
 		 582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 313 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  23.7 
 
 		 617 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  22.42 
 
 		 754 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  22.42 
 
 		 754 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  23.23 
 
 		 635 aa  101  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  36.49 
 
 		 382 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  40.3 
 
 		 277 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  24.16 
 
 		 589 aa  97.4  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  23.43 
 
 		 641 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.57 
 
 		 760 aa  94.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  26.28 
 
 		 576 aa  93.2  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  22.62 
 
 		 640 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  20.99 
 
 		 753 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  20.72 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  23.88 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  24.36 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  22.44 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  22.6 
 
 		 608 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 489 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  23.35 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  35.92 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  24.34 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  26.41 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  25.6 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.23 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.23 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  25.97 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  38.89 
 
 		 596 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  21.51 
 
 		 581 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  26.27 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  35.35 
 
 		 137 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  26.73 
 
 		 390 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  22.31 
 
 		 570 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  30.48 
 
 		 377 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 433 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  31.31 
 
 		 751 aa  55.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 412 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 413 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 		 455 aa  53.9  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  24 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  22.78 
 
 		 472 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  37.5 
 
 		 344 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  37.5 
 
 		 343 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  50.8  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  23.97 
 
 		 330 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 477 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  28.83 
 
 		 442 aa  48.1  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 556 aa  47.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.95 
 
 		 548 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  34.94 
 
 		 422 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  22.73 
 
 		 349 aa  45.8  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  32.98 
 
 		 367 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 433 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  24.1 
 
 		 370 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  24.1 
 
 		 370 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  27.59 
 
 		 470 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 561 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  43.9  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 223 aa  43.9  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>