34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1081 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  100 
 
 
492 aa  985    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  42.07 
 
 
705 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 
313 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  32.93 
 
 
756 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  39.87 
 
 
277 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 
632 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  26.8 
 
 
764 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  31.1 
 
 
778 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  34.97 
 
 
382 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  30.29 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 
208 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  37.68 
 
 
207 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 
561 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
230 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 
222 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 
390 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  30.88 
 
 
555 aa  47  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 
499 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 
209 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 
218 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 
241 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  31.54 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 
391 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  33.33 
 
 
483 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  29.03 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>