40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2438 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  38.92 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  26.52 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  32.08 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  26.18 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  30 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  32.05 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  27.69 
 
 
439 aa  65.1  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  28.43 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  28.75 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  27.47 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  26.8 
 
 
436 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  27.86 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  25.17 
 
 
264 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  25.31 
 
 
341 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  28.82 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  29.93 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  26.15 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4547  hypothetical protein  26.7 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.214497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  22.35 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  32.06 
 
 
183 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1684  hypothetical protein  24.83 
 
 
204 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1683  hypothetical protein  24.67 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2455  hypothetical protein  23.27 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  25.25 
 
 
382 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4150  hypothetical protein  25.62 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  33.02 
 
 
201 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  30.53 
 
 
195 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  33.33 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  33.64 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  26.04 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3230  hypothetical protein  26.92 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3687  hypothetical protein  26.19 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  29.6 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2822  hypothetical protein  27.52 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.645931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  27.84 
 
 
217 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  30.84 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  29.57 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>