31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0553 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 489 aa  990    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  39.49 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 313 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  36.36 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  30.41 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  34.97 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  28.28 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  42.19 
 
 		 756 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  24.68 
 
 		 764 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 499 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 208 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  37.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 561 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  30.06 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 160 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 230 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>