30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3359 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  100 
 
 		 348 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  37.27 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  35.92 
 
 		 705 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  36.11 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  41.67 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  30 
 
 		 756 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  25.88 
 
 		 764 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 499 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 208 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 433 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 160 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1666  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 218 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 138 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>