67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1573    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  63.14 
 
 		 756 aa  980    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  49.32 
 
 		 584 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  46.53 
 
 		 589 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 603 aa  255  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  28.36 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  25.95 
 
 		 778 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  24.68 
 
 		 754 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  24.68 
 
 		 754 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  25.47 
 
 		 760 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  26.06 
 
 		 575 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  29.18 
 
 		 705 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  26.22 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  25.49 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  24.4 
 
 		 753 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  25.13 
 
 		 555 aa  98.6  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  30 
 
 		 657 aa  97.8  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 492 aa  94  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  28.88 
 
 		 593 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 632 aa  90.9  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.03 
 
 		 548 aa  89  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  25.54 
 
 		 592 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  23.87 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  24.96 
 
 		 615 aa  83.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  29.82 
 
 		 221 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  29.82 
 
 		 221 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  28.81 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  25.45 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  26.37 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.09 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  26.71 
 
 		 382 aa  72  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  36.36 
 
 		 277 aa  72  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  22.77 
 
 		 593 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  29.69 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  37.5 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  21.6 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  25.38 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  34.27 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  34.29 
 
 		 582 aa  62  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  24.72 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  25.88 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  49.02 
 
 		 89 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 489 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  26.15 
 
 		 690 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  36.08 
 
 		 640 aa  57.4  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  35.05 
 
 		 641 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  28.74 
 
 		 472 aa  54.3  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  30.63 
 
 		 751 aa  54.3  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  51.6  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  22.75 
 
 		 390 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  24.12 
 
 		 687 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  32.95 
 
 		 344 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  32.5 
 
 		 178 aa  49.3  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  32.26 
 
 		 470 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  32.95 
 
 		 343 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  30.28 
 
 		 570 aa  48.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  25.84 
 
 		 390 aa  47.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  22.99 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  24.66 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  32.22 
 
 		 562 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  20.34 
 
 		 689 aa  45.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  25.35 
 
 		 529 aa  45.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  35.16 
 
 		 353 aa  44.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 499 aa  44.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  30.59 
 
 		 330 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>