37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0875 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  76.4 
 
 		 576 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  40.74 
 
 		 608 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  50.88 
 
 		 593 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  50 
 
 		 756 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  35.53 
 
 		 570 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  49.02 
 
 		 764 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  38.36 
 
 		 599 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  49.12 
 
 		 581 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  51.06 
 
 		 584 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  50 
 
 		 563 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  45.45 
 
 		 522 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  43.64 
 
 		 555 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  46.81 
 
 		 657 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  40 
 
 		 705 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  34.25 
 
 		 548 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  40.74 
 
 		 751 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  45.83 
 
 		 754 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  45.83 
 
 		 754 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  34.92 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  32.76 
 
 		 596 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  50 
 
 		 589 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  44.68 
 
 		 760 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  46.34 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  46.34 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  38.46 
 
 		 575 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  29.76 
 
 		 570 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  45.71 
 
 		 603 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  38.46 
 
 		 575 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 617 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  38.18 
 
 		 778 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  36 
 
 		 753 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  26.98 
 
 		 635 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  34.48 
 
 		 615 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  35 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  35 
 
 		 344 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>