61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2734 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  66.05 
 
 		 760 aa  981    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  100 
 
 		 753 aa  1522    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  58.41 
 
 		 754 aa  867    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  58.41 
 
 		 754 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  43.25 
 
 		 657 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  27.77 
 
 		 575 aa  190  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  28.75 
 
 		 570 aa  183  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  27.19 
 
 		 575 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  25.61 
 
 		 756 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  26.25 
 
 		 589 aa  117  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  24.4 
 
 		 764 aa  115  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  24.91 
 
 		 584 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  31.49 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0312  hypothetical protein  50.54 
 
 		 108 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  25.35 
 
 		 592 aa  94.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  23.5 
 
 		 608 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  25.38 
 
 		 778 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  23.92 
 
 		 522 aa  92  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0795  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  91.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  31.36 
 
 		 596 aa  88.2  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  25.25 
 
 		 593 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  25.35 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  24.67 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  22.07 
 
 		 588 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  21.77 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  24.39 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  21.59 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  23.27 
 
 		 640 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  26.27 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  26.27 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  25.33 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  40.43 
 
 		 615 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  42.05 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  24.09 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  24.07 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  25.87 
 
 		 617 aa  64.3  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  40 
 
 		 641 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  20.87 
 
 		 599 aa  61.6  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  25.31 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  36.19 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  35.56 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0743  hypothetical protein  31.52 
 
 		 100 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.174077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  37.21 
 
 		 546 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0726  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  23.11 
 
 		 402 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0378  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00277934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  30.85 
 
 		 582 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  25.98 
 
 		 390 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0765  hypothetical protein  36.99 
 
 		 95 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  19.35 
 
 		 690 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  28.26 
 
 		 137 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0907  hypothetical protein  28.37 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  24.67 
 
 		 422 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.57 
 
 		 470 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  31.87 
 
 		 267 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  28.87 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  30.21 
 
 		 341 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  27.37 
 
 		 377 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  25.81 
 
 		 390 aa  44.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  28 
 
 		 390 aa  44.3  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>