76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1500 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
377 aa  760    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  52.8 
 
 
422 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  36.13 
 
 
341 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.59 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  27.9 
 
 
377 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  26.1 
 
 
402 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  37.93 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  32.8 
 
 
390 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  30.86 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  28.2 
 
 
375 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  28.2 
 
 
375 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  28.28 
 
 
368 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  31.54 
 
 
345 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  26.13 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  26.8 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  25.8 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  31.75 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  25.76 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  25.28 
 
 
397 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  30.77 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  28.92 
 
 
354 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  23.64 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  24.36 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  24.62 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  26.5 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  24.83 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  25.14 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  23.32 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  30.65 
 
 
617 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.42 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  26.71 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  26.07 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  30.49 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  26.14 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.79 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  25.7 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  24.25 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  27.16 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  27.59 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  32.35 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  23.36 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  30.2 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  30.2 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  24.82 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.32 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  23.43 
 
 
650 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  27.7 
 
 
375 aa  62.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  25.56 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  27.57 
 
 
349 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  27.54 
 
 
363 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  28.25 
 
 
320 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  31.86 
 
 
159 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  30.48 
 
 
705 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  26.6 
 
 
638 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  40.98 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  26.35 
 
 
589 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  23.98 
 
 
754 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  23.98 
 
 
754 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  29.91 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  41.51 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  37.7 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  30.1 
 
 
596 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  22.67 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  23.32 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  25.96 
 
 
548 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  32.29 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  27.37 
 
 
753 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.12 
 
 
760 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  26.01 
 
 
470 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  29.25 
 
 
575 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  25.57 
 
 
593 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  33 
 
 
690 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  30 
 
 
575 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  28.57 
 
 
555 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>