21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0874 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  967    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  59.78 
 
 
576 aa  555  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  31.41 
 
 
599 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  26.31 
 
 
608 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  28.12 
 
 
593 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  25.66 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  23.06 
 
 
563 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  23.58 
 
 
754 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  23.58 
 
 
754 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.35 
 
 
753 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  23.31 
 
 
760 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  22.95 
 
 
657 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  23.97 
 
 
570 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  22.01 
 
 
575 aa  56.6  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  21.86 
 
 
575 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  28.74 
 
 
764 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  21.43 
 
 
570 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  22.4 
 
 
548 aa  47  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  21.78 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  22.35 
 
 
584 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  23.9 
 
 
522 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>