44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2266 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1229    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  40.99 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  35.23 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  33.22 
 
 		 599 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  27.92 
 
 		 563 aa  177  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  29.54 
 
 		 576 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  28.3 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  28.88 
 
 		 764 aa  93.6  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  23.25 
 
 		 657 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.25 
 
 		 753 aa  87  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  20.72 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  23.66 
 
 		 760 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  23.09 
 
 		 754 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  23.09 
 
 		 754 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  27.95 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.13 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.65 
 
 		 548 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.35 
 
 		 705 aa  74.3  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  24.36 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  27.38 
 
 		 589 aa  73.9  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  25.85 
 
 		 575 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  20.43 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  24.5 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  21.56 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  50.88 
 
 		 89 aa  63.9  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  21.33 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  23.95 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  26.98 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  20.23 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  26.02 
 
 		 603 aa  53.9  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  22.22 
 
 		 570 aa  51.6  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5121  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.910075  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  50.4  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  20.43 
 
 		 546 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  29.29 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  33.66 
 
 		 615 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  25.93 
 
 		 640 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  27.18 
 
 		 617 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  25.93 
 
 		 641 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  32.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  32.58 
 
 		 778 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  24.81 
 
 		 635 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4019  hypothetical protein  31.94 
 
 		 89 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  27.08 
 
 		 591 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>