67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0825 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  62.43 
 
 
760 aa  964    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  58.41 
 
 
753 aa  867    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  100 
 
 
754 aa  1532    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  100 
 
 
754 aa  1532    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  46.84 
 
 
657 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  30.34 
 
 
575 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  30.92 
 
 
575 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  30.7 
 
 
570 aa  226  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  28.74 
 
 
584 aa  162  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  29.15 
 
 
589 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  26.36 
 
 
596 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  24.68 
 
 
764 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  26.07 
 
 
603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  26.15 
 
 
522 aa  124  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  25.87 
 
 
756 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  24.82 
 
 
576 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  24.78 
 
 
592 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  26.01 
 
 
617 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  24.14 
 
 
555 aa  107  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  23.92 
 
 
582 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0312  hypothetical protein  46.46 
 
 
108 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  25.08 
 
 
608 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  22.96 
 
 
598 aa  95.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  22.77 
 
 
548 aa  94  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  23.58 
 
 
472 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0795  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  22.6 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  22.01 
 
 
593 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  22.96 
 
 
593 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  24.31 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  22.35 
 
 
705 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  22.55 
 
 
690 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  37.11 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  40 
 
 
641 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  24.5 
 
 
570 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  40.45 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0743  hypothetical protein  32.99 
 
 
100 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.174077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  37.78 
 
 
640 aa  67.4  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  26.39 
 
 
581 aa  64.7  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  30.17 
 
 
118 aa  64.3  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  37.11 
 
 
615 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0726  hypothetical protein  31.96 
 
 
100 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  38.46 
 
 
89 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  23.21 
 
 
221 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  23.21 
 
 
221 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  23.77 
 
 
563 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  33.71 
 
 
402 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  35.96 
 
 
635 aa  58.9  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  33 
 
 
751 aa  58.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  22.68 
 
 
598 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.26 
 
 
330 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  30.97 
 
 
128 aa  54.7  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0765  hypothetical protein  33.78 
 
 
95 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24.23 
 
 
343 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  29.59 
 
 
344 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  32.14 
 
 
137 aa  51.2  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0907  hypothetical protein  28.07 
 
 
446 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  31.03 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  25 
 
 
422 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  23.98 
 
 
377 aa  48.9  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  45.83 
 
 
89 aa  48.5  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  30.77 
 
 
470 aa  47.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0378  hypothetical protein  28.57 
 
 
90 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00277934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  29.33 
 
 
390 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  19.82 
 
 
646 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  40.48 
 
 
74 aa  44.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  26.04 
 
 
377 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>