51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2015 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1216    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  52.75 
 
 
584 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  48.98 
 
 
756 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  46.53 
 
 
764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  31.18 
 
 
596 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  31.9 
 
 
603 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  27.75 
 
 
760 aa  163  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  29.15 
 
 
754 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  29.15 
 
 
754 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  24.01 
 
 
575 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  24.76 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  23.93 
 
 
575 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  26.25 
 
 
753 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  25.19 
 
 
522 aa  97.8  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  23.77 
 
 
555 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  26.06 
 
 
548 aa  95.5  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  31.17 
 
 
657 aa  90.5  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  28.09 
 
 
705 aa  83.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  20.41 
 
 
599 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  27.38 
 
 
593 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  28.84 
 
 
608 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  28.88 
 
 
546 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  25.29 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 
593 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  38.61 
 
 
617 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  21.13 
 
 
641 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  37.39 
 
 
615 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  25 
 
 
581 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  34.68 
 
 
778 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  24.66 
 
 
221 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  33.04 
 
 
128 aa  62  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  24.66 
 
 
221 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 
576 aa  61.2  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
588 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  25.62 
 
 
592 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  24.01 
 
 
598 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  28.74 
 
 
582 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  21.33 
 
 
563 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  31.62 
 
 
635 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  26.84 
 
 
570 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  35 
 
 
640 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  32.63 
 
 
137 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  30.61 
 
 
751 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  27.43 
 
 
690 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  47.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  27.59 
 
 
402 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  21.78 
 
 
472 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  21.4 
 
 
646 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  29 
 
 
562 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  29 
 
 
562 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  25.56 
 
 
366 aa  43.9  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>