63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3603 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1165    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  49.57 
 
 
575 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  49.23 
 
 
575 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  30.7 
 
 
754 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  30.7 
 
 
754 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  30.21 
 
 
760 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  29.12 
 
 
657 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  28.75 
 
 
753 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  26.22 
 
 
764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  24.96 
 
 
596 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  26.38 
 
 
756 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  24.76 
 
 
589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  25.44 
 
 
584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  22.76 
 
 
548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  24.63 
 
 
592 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.02 
 
 
705 aa  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  23.56 
 
 
608 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  23.49 
 
 
576 aa  100  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  29.43 
 
 
603 aa  98.6  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  23.86 
 
 
582 aa  97.8  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  23.55 
 
 
555 aa  94  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  23.63 
 
 
522 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  24.43 
 
 
690 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  20.87 
 
 
593 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  23.78 
 
 
615 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  23.37 
 
 
641 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  23.27 
 
 
581 aa  80.9  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  23.89 
 
 
640 aa  80.1  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  22.79 
 
 
588 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  20.55 
 
 
599 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  25.95 
 
 
617 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  24.73 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  22.55 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  27.14 
 
 
570 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  26.15 
 
 
635 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  28.69 
 
 
137 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  31.93 
 
 
751 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  35.19 
 
 
598 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  36.13 
 
 
778 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  22.46 
 
 
563 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  22.76 
 
 
221 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  22.76 
 
 
221 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  31.48 
 
 
128 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3970  hypothetical protein  33.33 
 
 
536 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00762799  normal  0.606587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  29.13 
 
 
390 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  21.43 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  29.35 
 
 
343 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  31.76 
 
 
344 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  30.85 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  29.47 
 
 
341 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
249 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  30.23 
 
 
402 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  19.5 
 
 
598 aa  47  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  28.72 
 
 
399 aa  46.2  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  31 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  32.29 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  32.97 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  26.67 
 
 
550 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  32.05 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  29.35 
 
 
349 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  29.76 
 
 
89 aa  44.3  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  30.91 
 
 
422 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  28.72 
 
 
366 aa  43.9  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>