53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0892 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1142    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  27.49 
 
 		 593 aa  173  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  25.98 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  25.99 
 
 		 608 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  26.18 
 
 		 599 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  24.57 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  23.06 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  25.82 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  25.45 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.3 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.37 
 
 		 705 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  24.07 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  23.02 
 
 		 760 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  20.22 
 
 		 756 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  24.34 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  23.77 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  23.77 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  22.46 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  21.33 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  19.83 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.06 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.06 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  31.15 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  20.84 
 
 		 575 aa  57  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  23.22 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  30.87 
 
 		 588 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  20.94 
 
 		 751 aa  54.7  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  33.06 
 
 		 522 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  23.43 
 
 		 575 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  29.2 
 
 		 582 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  30.47 
 
 		 592 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  29.2 
 
 		 640 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  21.07 
 
 		 704 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  24.03 
 
 		 690 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  28.32 
 
 		 641 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  29.03 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  32.54 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  32.54 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  27.83 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  30.43 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  30.58 
 
 		 593 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  26.87 
 
 		 778 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  21.35 
 
 		 596 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  28.28 
 
 		 137 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  31.25 
 
 		 593 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  25.77 
 
 		 600 aa  45.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  28.3 
 
 		 635 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  28.97 
 
 		 659 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  25.6 
 
 		 722 aa  43.9  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  26.95 
 
 		 785 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.72 
 
 		 699 aa  43.5  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>