44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3225 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
588 aa  1212    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  47.95 
 
 
598 aa  569  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  49.67 
 
 
615 aa  555  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  49.08 
 
 
592 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  48.14 
 
 
593 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  47.99 
 
 
635 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  47.32 
 
 
778 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  46.39 
 
 
617 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  44.77 
 
 
641 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  43.9 
 
 
640 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  27.93 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  25.13 
 
 
548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  24.41 
 
 
522 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  23.48 
 
 
690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  24.28 
 
 
598 aa  110  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  22.34 
 
 
555 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.29 
 
 
705 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.54 
 
 
575 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  23.87 
 
 
764 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  21.96 
 
 
575 aa  83.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  22.07 
 
 
753 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  23.82 
 
 
584 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  22.79 
 
 
570 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  22.05 
 
 
603 aa  75.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  23.21 
 
 
756 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  24.31 
 
 
754 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  24.31 
 
 
754 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  22.65 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  27.82 
 
 
570 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  50.91 
 
 
74 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  30.83 
 
 
760 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 
589 aa  60.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  23.69 
 
 
221 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  23.69 
 
 
221 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  20.17 
 
 
593 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  54.9 
 
 
60 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  33.86 
 
 
128 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  24.17 
 
 
596 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  30.87 
 
 
563 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  21.37 
 
 
599 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  32.08 
 
 
89 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  24.32 
 
 
402 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  31.36 
 
 
608 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>