51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1826 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
546 aa  1097    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  25.75 
 
 
522 aa  97.8  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  22.3 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  24.93 
 
 
555 aa  88.6  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  25.46 
 
 
221 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  25.46 
 
 
221 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  23.96 
 
 
575 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  21.14 
 
 
705 aa  77  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  28.33 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  28.81 
 
 
764 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  26.25 
 
 
756 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  24.73 
 
 
570 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  28.88 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  27.86 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  40.45 
 
 
754 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  40.45 
 
 
754 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  28.21 
 
 
603 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  38.2 
 
 
760 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  36.96 
 
 
575 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  23 
 
 
657 aa  60.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  22 
 
 
608 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  37.21 
 
 
753 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  42 
 
 
581 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  22.84 
 
 
576 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  32.04 
 
 
778 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  20.43 
 
 
593 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  28.12 
 
 
617 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  32.61 
 
 
592 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  27.83 
 
 
563 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  34.69 
 
 
635 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  28.87 
 
 
641 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  29.9 
 
 
640 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  32.18 
 
 
582 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  34.92 
 
 
89 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  25.53 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  25.53 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  21.46 
 
 
402 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  23.02 
 
 
664 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  31.52 
 
 
593 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  39.02 
 
 
599 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  28.03 
 
 
751 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3970  hypothetical protein  34.74 
 
 
536 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00762799  normal  0.606587 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  32.91 
 
 
722 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  25.37 
 
 
638 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  24.64 
 
 
349 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  28.97 
 
 
649 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  28.32 
 
 
842 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  20.1 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  20.1 
 
 
375 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.91 
 
 
772 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  27.55 
 
 
550 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>