54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4878 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1276    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  45.34 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  46.39 
 
 		 588 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  43.85 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  41.72 
 
 		 641 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  42.74 
 
 		 592 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  41.32 
 
 		 640 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  42.95 
 
 		 598 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  42.53 
 
 		 778 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  41.05 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  26.03 
 
 		 582 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  26.01 
 
 		 754 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  26.01 
 
 		 754 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  23.2 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.15 
 
 		 522 aa  104  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  24.47 
 
 		 598 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.16 
 
 		 548 aa  101  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  24.41 
 
 		 760 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  21.29 
 
 		 690 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  22.57 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  29.25 
 
 		 756 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.63 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  22.55 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  25.95 
 
 		 570 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  21.95 
 
 		 575 aa  70.1  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  34.27 
 
 		 764 aa  67.8  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  61.36 
 
 		 60 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  38.61 
 
 		 589 aa  67  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.87 
 
 		 753 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  28.09 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  35 
 
 		 657 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  32.63 
 
 		 137 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  38.6 
 
 		 89 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  31.07 
 
 		 576 aa  51.2  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  28.12 
 
 		 546 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  40.35 
 
 		 118 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  30.63 
 
 		 390 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  21.83 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  21.83 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  30.43 
 
 		 563 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  24.54 
 
 		 603 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  27.18 
 
 		 593 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  32.47 
 
 		 249 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  23.59 
 
 		 600 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  29.09 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  30.39 
 
 		 689 aa  45.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  38.98 
 
 		 128 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  25.53 
 
 		 344 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  20.07 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  25.53 
 
 		 343 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2679  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.353369  normal  0.0921566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  28.85 
 
 		 386 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>