15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1401 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  249  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  95.24 
 
 		 89 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  46.96 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  46.15 
 
 		 603 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  41.74 
 
 		 596 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  30.17 
 
 		 754 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  30.17 
 
 		 754 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  28.32 
 
 		 760 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  40.35 
 
 		 617 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  23.36 
 
 		 575 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  30.36 
 
 		 584 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  23.36 
 
 		 575 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  36.17 
 
 		 593 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  30.19 
 
 		 588 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  25 
 
 		 589 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>