20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1414 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  187  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  95.24 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  47.06 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  49.41 
 
 		 603 aa  88.2  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  45.98 
 
 		 596 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  38.46 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  38.46 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  38.6 
 
 		 617 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  38.3 
 
 		 593 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  37.93 
 
 		 584 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  32.08 
 
 		 588 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  31.82 
 
 		 760 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 657 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  33.96 
 
 		 598 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 598 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  30.77 
 
 		 589 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  23.33 
 
 		 575 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  23.81 
 
 		 575 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  30.19 
 
 		 592 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  26.79 
 
 		 615 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>