56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0246 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1347    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  47.46 
 
 
760 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  46.84 
 
 
754 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  46.84 
 
 
754 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  43.25 
 
 
753 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  29.41 
 
 
575 aa  217  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  29.12 
 
 
570 aa  216  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  28.52 
 
 
575 aa  209  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  25.2 
 
 
756 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  24.91 
 
 
576 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  25.22 
 
 
555 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  32.9 
 
 
584 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  24.33 
 
 
608 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  30 
 
 
764 aa  97.8  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  29.96 
 
 
603 aa  96.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  23.18 
 
 
593 aa  91.3  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  30.49 
 
 
596 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.55 
 
 
522 aa  90.1  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  31.17 
 
 
589 aa  90.5  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  22.61 
 
 
592 aa  87.4  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  22.84 
 
 
548 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  22.67 
 
 
690 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  22.95 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  22.65 
 
 
588 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  22.26 
 
 
598 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  28.46 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  34.04 
 
 
705 aa  64.7  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  25.79 
 
 
598 aa  63.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  20.16 
 
 
599 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  22.91 
 
 
570 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  24.14 
 
 
221 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  24.14 
 
 
221 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  23 
 
 
546 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  33.33 
 
 
778 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  19.83 
 
 
563 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  37.5 
 
 
635 aa  57.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  31.52 
 
 
641 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  35 
 
 
617 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  30.43 
 
 
640 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  37.21 
 
 
593 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  55.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  24.09 
 
 
390 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  33 
 
 
615 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  46.81 
 
 
89 aa  51.6  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3970  hypothetical protein  24.93 
 
 
536 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00762799  normal  0.606587 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  32.97 
 
 
137 aa  50.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  23.81 
 
 
470 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  23.72 
 
 
582 aa  48.9  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  31.71 
 
 
344 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  31.71 
 
 
343 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  29.55 
 
 
402 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  32.22 
 
 
751 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  23.53 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  20.43 
 
 
646 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  29.63 
 
 
499 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>