12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3970 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3970  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1077    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00762799  normal  0.606587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  24.93 
 
 
657 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  21.85 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  33.67 
 
 
522 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  30.53 
 
 
575 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  29.17 
 
 
756 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  23.88 
 
 
760 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  29.91 
 
 
603 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  35.42 
 
 
546 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  23.85 
 
 
754 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  23.85 
 
 
754 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>