53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  100 
 
 		 603 aa  1248    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  44.5 
 
 		 596 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  31.9 
 
 		 589 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  30.43 
 
 		 584 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  28.78 
 
 		 756 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  26.07 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  26.07 
 
 		 754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  46.15 
 
 		 118 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  32.48 
 
 		 760 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  31.49 
 
 		 753 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  29.43 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  29.96 
 
 		 657 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  28.57 
 
 		 575 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  22.36 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  27.17 
 
 		 575 aa  90.9  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  49.41 
 
 		 89 aa  88.2  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  22.05 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  29.11 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  26.12 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  28.21 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  23.26 
 
 		 608 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  28.95 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  28.95 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  26.14 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  38.71 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  30.19 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  35.79 
 
 		 751 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  29.52 
 
 		 522 aa  54.3  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  26.02 
 
 		 593 aa  54.3  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  22.14 
 
 		 592 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  22.81 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  29.63 
 
 		 576 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  24.2 
 
 		 593 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  34.09 
 
 		 330 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  22.08 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  24.54 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  21.09 
 
 		 599 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0247  hypothetical protein  25.18 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  34.48 
 
 		 562 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  34.48 
 
 		 562 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  28.1 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  26.73 
 
 		 641 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  32.22 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  21.21 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  32.22 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3970  hypothetical protein  25.85 
 
 		 536 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00762799  normal  0.606587 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  27.84 
 
 		 778 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  26.32 
 
 		 707 aa  44.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  24.07 
 
 		 635 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>