70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0608 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  743    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  41.55 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  39.72 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  37.36 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  37.46 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  37.65 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  36.52 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  32.59 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  30.55 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  32.13 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  28.61 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.73 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  31.11 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  32.13 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  28.39 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  28.4 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  29.78 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  28.4 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  31.13 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  32.32 
 
 		 470 aa  97.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.35 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  28.79 
 
 		 397 aa  95.9  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  31.16 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  25.62 
 
 		 399 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  32.98 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  30.83 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  29.97 
 
 		 617 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  25.24 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  28.68 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  28.68 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  31.98 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  28.89 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  31.11 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  26.5 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.61 
 
 		 638 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.73 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  34.87 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  30.1 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  32.28 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  29.67 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  24.3 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  29.79 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  31.82 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  27.23 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  32.73 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  25.62 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  27.45 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  25.9 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  27.54 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  26.32 
 
 		 194 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  29.37 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  24.85 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  23.24 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  27.66 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24.29 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  26.67 
 
 		 603 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  22.35 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  30.53 
 
 		 584 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  24.69 
 
 		 589 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  26.15 
 
 		 168 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  27.47 
 
 		 548 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  33.67 
 
 		 756 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  25 
 
 		 589 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  28.72 
 
 		 570 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  20.74 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>