61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3547 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  940    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  40 
 
 		 617 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  37.6 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  37.33 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  38.5 
 
 		 375 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  37.01 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  35.61 
 
 		 375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  33.62 
 
 		 539 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  35.66 
 
 		 370 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  29.08 
 
 		 650 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.39 
 
 		 349 aa  120  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  32.06 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  30.6 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  29.28 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  30.45 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.28 
 
 		 638 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  27.19 
 
 		 354 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.52 
 
 		 371 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  27.53 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  31.44 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  24.15 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  36.22 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  28.78 
 
 		 374 aa  96.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  27.15 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  27.15 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  30.15 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  25.98 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  24.93 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  26.38 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  27.66 
 
 		 341 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  30.28 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  30.28 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  30.5 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  31.11 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  29.84 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  27.9 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  26.67 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  29.28 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  26.59 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  32.35 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  32.68 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  23.86 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  27.52 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  30.23 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  24.52 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  29.26 
 
 		 394 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  24.31 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  27.88 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  36.26 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  30.46 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  27.44 
 
 		 589 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  27.23 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  23.74 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  26.92 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  27.92 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  29.67 
 
 		 390 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>