29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4256 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  33.09 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  31.82 
 
 
366 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  30.43 
 
 
365 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  31.62 
 
 
353 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.99 
 
 
391 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  30.43 
 
 
367 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  29.69 
 
 
194 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  31.82 
 
 
406 aa  57  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  26.57 
 
 
349 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  36.56 
 
 
354 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  27.46 
 
 
394 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  31.13 
 
 
396 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 
370 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 
370 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  29.29 
 
 
370 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.18 
 
 
638 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  28.28 
 
 
389 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  32.14 
 
 
374 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  31.31 
 
 
470 aa  47  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  32.65 
 
 
379 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  34.38 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  30.43 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  30.53 
 
 
617 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  22 
 
 
371 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  27.62 
 
 
650 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
399 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  29.79 
 
 
539 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0465  hypothetical protein  31.03 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.559126  normal  0.33995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>